Охорона будівель і території музею та філій, в т. ч. фізична та за допомогою технічних засобів, супровід, технічне обслуговування системи відеоспостереження, охоронної та пожежної сигналізації, пожежне спостереження.

Постановою Кабінету Міністрів України від 21.11.2018 № 975 «Про затвердження категорій об’єктів державної форми власності та сфер державного регулювання, які підлягають охороні органами поліції охорони на договірних засадах» затверджено перелік категорій об’єктів державної форми власності та сфер державного регулювання, які підлягають охороні органами поліції охорони на договірних засадах. Згідно п.10 переліку, охороні підлягають музейні заклади, в яких зберігаються музейні предмети державної частини Музейного фонду України, внесені до Державного реєстру національного культурного надбання. На виконання наказу Міністерства культури і мистецтв України від 25.10.2001 р. № 653 та постанови колегії управління культури і туризму Вінницької ОДА від 27.12.2005 р. №7/3, управління культури і туризму Вінницької ОДА надіслало перелік предметів із колекції Вінницького обласного краєзнавчого музею 23.02.2006 р. № 257/02-21 для включення до Державного реєстру національного культурного надбання. Приміщення музею за адресою м. Вінниця, вул. Соборна,19 є пам’яткою архітектури національного значення «Келії Єзуїтського монастиря (охор.№54/3)» занесеною до Державного реєстру нерухомих пам’яток культурної спадщини. Беручи до уваги вищевикладені факти, а також те, що Постанова Кабінету Міністрів України від 10.08.1993 №615 в редакції від 25.11.2015 чинна, охорона Вінницького обласного краєзнавчого музею повинна надалі здійснюватися виключно поліцією охорони.